Hondo et l'équipe SWAT s'associent au FBI pour tenter de démenteler une attaque terroriste. Certains membres d'une milice planifient une attaque au cyanure. Parallèlement, les nouvelles initiatives policières de Jessica avec Michael Plank, qui est le président de la commission de police, progressent.

Cette fois, Hondo fait équipe avec un vieil ami de la DEA dans le cadre d'un groupe de travail. Ensemble, ils sont chargés de démanteler un réseau de trafic de drogue afin de démasquer le chef secret d'un réseau de contrebande.

L'équipe du SWAT se rend dans une prison pour intervenir lors d'une émeute et sauver des otages civils. Hondo pense que ce soulèvement cache un plan des détenus. Parallèlement, alors que la femme de Deacon, Annie, passe au quartier général pour célébrer le 10ème anniversaire de son mari avec l'équipe, sa visite prend un tour inattendu.

Lorsqu'une plainte déposée contre Hondo l'oblige à faire un pas de côté, Deacon prend la tête de l'équipe pour trouver les voleurs qui attaquent les dispensaires de marijuana. Tan remarque une similitude entre les vols actuels et une ancienne enquête qu'il menait à la criminelle de Los Angeles et demande l'aide d'un informateur avec qui il a une histoire compliquée.