L'équipe échappe à une explosion survenue chez Mason Industries mais Lucy est portée disparue. Réfugiés dans un bunker, Wyatt et Rufus localisent le vaisseau principal en 1918, en France.
La poursuite du clan Rittenhouse continue pour l'équipe qui s'envole pour la Caroline du Sud des années 50. Wyatt, Lucy et Rufus se retrouvent en pleine course de stock-cars et forment une alliance avec Wendell Scott.
Les crises de Jiya s'intensifient, provoquant chez elle de troublantes visions. Lucy, Wyatt et Rufus sont envoyés à Hollywood en 1941 pour récupérer l'unique copie de « Citizen Kane », volée par Rittenhouse.
4. Les sorcières de Salem
Après une découverte déconcertante, Wyatt s'échappe du bunker. Lucy et Rufus partent cependant en mission. Ayant besoin d'un soldat à leurs côtés, ils emmènent Flynn, leur ancien ennemi.
5. La malédiction des Kennedy
Suite à une attaque de Rittenhouse en 1934, Wyatt et Rufus reviennent en catastrophe au bunker. Cependant, dans la précipitation et dans le but de le sauver, ils reviennent avec JFK, alors âgé de 17 ans.
Pour la première fois, quatre places sont disponibles dans le vaisseau. Connor Mason se joint donc à l'équipe pour sauver Robert Johnson, un pionnier du blues dont il est fan, des mains de Rittenhouse.
New York, le 4 mars 1919. Le Président Wilson s'apprête à négocier le célèbre traité de Versailles. C'est également l'époque d'Alice Paul, la présidente du mouvement des suffragettes.
Wyatt, Lucy, Rufus et Jiya se retrouvent à Washington en 1981. Ils découvrent rapidement que la cible des Rittenhouse est l'agent Denise Christopher à l'époque où elle était encore une jeune policière.
Rittenhouse décide de changer le cours de l'histoire en bouleversant l'issue de la guerre civile de 1863 en Caroline du Sud. L'équipe, aidée par Harriet Tubman, fait tout pour contrer le plan de Rittenhouse.
Grâce à un complice présent dans le bunker, le clan Rittenhouse réussit à voler le vaisseau et prend Jiya en otage. Cependant, la pilote finit par s'échapper mais reste bloquée en 1888.
11. Le miracle de Noël - Partie 1
Noël arrive dans le bunker. Avec l'aide de leurs doubles du futur, Lucy et Wyatt entraînent le reste de l'équipe dans une ruée vers l'or en Californie en 1848, dans le but de sauver Rufus et de neutraliser Rittenhouse.
12. Le miracle de Noël - Partie 2
Emma entraîne Lucy, Wyatt, Rufus et Jiya dans la guerre de Corée en 1950. Son choix et les événements qui s'ensuivent obligent Christopher et Mason à intervenir pour tenter de les sauver et arrêter Rittenhouse.