Deux mois ont passé depuis l'attentat. Maintenant que le directeur Estes est mort et que Brody a disparu des radars, la CIA, qui déplore plus de 200 pertes humaines dans ses rangs, semble décapitée.
Carrie est folle de rage car Saul ne l'a pas soutenue devant la commission d'enquête du congrès. Pour se venger, la jeune femme décide de livrer à la presse sa propre version des faits.
Une bande de dealers vénézuéliens se porte au secours de Brody, grièvement blessé par des Colombiens à la frontière. Entre la vie et la mort, il est emmené à Caracas, dans un immeuble en construction servant de squat.
Farah découvre un élément capital sur des détournements de fonds destinés à financer des terroristes. Cette piste mène Saul à Caracas...
Acculé par tous ses mensonges, Brody, dont les idées sont de plus en plus confuses, cède sous la pression et décide de cesser sa collaboration avec Abu Nazir.
Avec l'aide de Fara et Quinn, Saul fait l'impossible afin de localiser Carrie le plus discrètement possible. Il ignore que cette dernière est en pleine confrontation avec Majid Javadi.
Dans les plus hautes sphères de l'Etat, c'est le branle-bas de combat pour coincer l'ennemi public numéro un : Nick Brody. Dans ce chaos professionnel et personnel, Saul et Carrie tentent de surnager...
Il ne reste que neuf jours à Saul dans ses fonctions de directeur de la CIA par intérim. Il profite de ce temps pour charger une équipe de vérifier la suggestion de Majid selon laquelle Brody n'aurait pas posé la bombe.
Saul a retrouvé la trace de Brody à Caracas et s'est porté à son secours. Il tente de l'aider à surmonter sa dépendance aux stupéfiants. L'équipe de Quinn découvre que l'amant de la femme de Saul est un agent du Mossad.
Brody se retrouve à présent dans la peau d'un agent de la CIA et va devoir participer à une mission périlleuse à la frontière irano-irakienne... Saul, quant à lui, est mis sous pression par le sénateur Lockhart.
Suite à un habile stratagème, Nicholas Brody débarque à Téhéran. Soupçonneux, Majid Javadi le soumet à plusieurs interrogatoires afin de découvrir ses véritables intentions.
Après avoir exécuté sa cible, Brody s'enfuit en prenant en otage un garde de l'IRGC. Il retrouve Carrie et tous deux vont se cacher dans le désert, à plusieurs heures de route de Téhéran.